L'Institut té el seu antecedent en 1986 amb la creació del Departament de Tecnologia Agroalimentària, dependent del Servei de Recerca i Desenvolupament Tecnológicoe la Junta d'Extremadura, desenvolupant les competències en matèria de R+D de tots els aspectes tecnològics que incideixen en els diversos productes agroalimentaris de la regió extremenya. En 1994, assumeix la seva gestió la Direcció general de Comerç de la Conselleria d'Economia i Treball de la Junta d'Extremadura. A través de l'el Decret 2/2005, d'11 de gener, va passar a dependre de la Direcció general de Recerca, Desenvolupament Tecnològic i Innovació de la Conselleria d'Infraestructures i Desenvolupament Tecnològic. Posteriorment mitjançant el Decret 17/2007, de 30 de juny, les competències són transferides a la nova Vicepresidència 2ª i Conselleria d'Economia, Comerç i Innovació dins de la qual es delega la gestió a la Direcció general d'Innovació i Competitivitat Empresarial.
Està situat en la Finca “Santa Engracia” (Badajoz) i disposa d'una superfície superior als 10.000 metres quadrats per al desenvolupament de la seva activitat.
Compta amb un àrea general d'Administració, i cinc àrees de treball associades a sectors de producció i transformació, dotades de moderns laboratoris i plantes pilot amb el més avançat equipament, en les quals es pot desenvolupar el procés escalat amb posterior utilització en la indústria.
Tot a fi d'atendre les necessitats de la indústria agroalimentària extremenya, on el mercat redueix el cicle de vida dels productes, obligant a una innovació permanent en els mateixos i els seus processos i on es busca l'establiment d'una qualitat homogènia i adequada en els seus productes, cobrint la demanda creixent per part del consumidor final de productes de la més alta qualitat.
Les seves principals àrees de treball són:
Productes Hortofrutícolas
Productes Cárnicos
Productes Làctics
Oliïs
Enologia