Veolia y sus socios desarrollan su sistema de alerta temprana para identificar y cuantificar las variantes del SARS-CoV-2 en las aguas residuales
Veolia, el IPMC (CNRS-Université Cote d’Azur), la start up IAGE y el BMPM (Bataillon des Marins Pompiers de Marseille) continúan colaborando para optimizar Vigie COVID-19, su solución pionera para detectar y cuantificar la presencia de SARS-CoV-2 en aguas residuales en un tiempo récord. Iniciado en septiembre de 2020, este método ya ha permitido detectar y cuantificar las variantes alfa, beta y gamma, posteriormente la variante delta este verano y, en la actualidad, la variante ómicron.
Utilizado experimentalmente como complemento a los datos clínicos existentes, la presencia de Sars-Cov-2 en aguas residuales tiene la posibilidad de convertirse en un nuevo indicador para ayudar a gestionar la pandemia. En Francia, el Laboratorio Nacional de Referencia designado por los Ministerios de Salud y para la Transición Ecológica (1) ha puesto en marcha recientemente un proceso para armonizar y consolidar los mencionados métodos de seguimiento.
La solución Vigie COVID-19 es la más operativa en Europa para cuantificar el SARS-CoV-2 en aguas residuales hasta la fecha. Con las técnicas de cribado por PCR, la solución permite identificar la presencia de mutaciones conocidas procedentes de variantes existentes y evaluar su concentración. De esta manera, los métodos de secuenciación identifican las mutaciones, así como las proporciones de las variantes.
La campaña de detección de la variante ómicron, llevada a cabo por Veolia y sus socios en diciembre en una decena de emplazamientos municipales e industriales de toda Europa, permitió continuar reforzando la solución Vigie COVID-19 con varios avances importantes:
- Solo se necesitan dos semanas para poner en marcha una campaña de seguimiento de una nueva variante;
- El cribado por PCR de una muestra solo requiere unas pocas horas;
- La secuenciación de una muestra tarda menos de un día sin un ajuste previo;
- Los resultados se pueden utilizar en cuanto la nueva variante surge en una región.
Philippe Sébérac, directora de Conocimientos Científicos y Tecnológicos, declara que "con el éxito de nuestra tercera campaña que demuestra la eficacia de Vigie Covid-19, en colaboración con nuestros socios, estamos preparados para ponerla a disposición de un mayor número de participantes. Un despliegue a gran escala permitiría cruzar estos datos con los de las autoridades sanitarias locales, al reforzar la red territorial. Nuestro método puede constituir, de este modo, un excelente complemento a los ensayos clínicos en la lucha contra la expansión de la pandemia, proporcionando información legible y dinámica coherente con las tasas de incidencia comunicadas por las autoridades sanitarias en Europa”.
